Friedrich III. von Schleswig-Holstein-Gottorf (* 22. Dezember 1597 ; † 10. August 1659 ) war von 1616 bis 1659 Herzog von Schleswig-Holstein-Gottorf.

Der erstgeborener Sohn von Johann Adolf und Augusta, Tochter von König Friedrich II. von Dänemark übernahm 1616 von seinem Vater das Herzogtum.

Er hatte ehrgeizige Pläne mit seinem Land. So suchte Friedrich Anschluss an den sich entwickelnden Überseehandel. Zu diesem Zweck gründete er 1621 Friedrichstadt, nach dem Vorbild des 1617 von Christian IV. gegründten Glückstadt.

Des weiteren versuchte er eine Handelsroute nach Russland und Persien zu finden, die nicht um Afrika herum führte. Aus diesem Grund entsandte am 6. November 1633 von Hamburg aus eine Epedition nach Moskau. Die Leitung hatte der Kaufmann Otto Brüggemann und der herzogliche Rat Philipp Crusius inne. Sekretär der 34 Personen umfassenden Epedition war Adam Olearius . Am 14. August 1634 traf die Delegation in Moskau ein. Zwar gelang es nicht mit Zar Michael I. ein Handeslabkommen zu schließen, doch wurde sofort nach der Rückkehr der Delegation am 6. April 1635 nach Schloss Gottorf mit der Vorbereitung der nächsten Expedition begonnen.

Die sollte an den Persischen Hof nach Isfahan führen. Die Leitung lag wieder in den Händen des Kaufmanns Brüggemann. Mitglieder der Delegation waren, neben dem Sekretär Olearius, u. a. Albrecht von Mandeloh , Hans Christoph von Uechtritz und Paul Fleming. Am 22. Oktober 1635 begann die Reise in Hamburg. Über Moskau und nach einem Schiffbruch im Kaspischen Meer erreichte die Expedition am 3. August 1637 endlich Isfahan.

Auf Grund des selbstherrlichen Verhaltens der Mitglieder der Delegation wurde die Reise ein totaler Fehlschlag. Am 21. Dezember musste die Expedition unverrichteter Dinge wieder abziehen. Am 1. August 1639 erreichte sie wieder Gottorf. Der Leiter Brüggemann wurde alleine für das Scheitern verantwortlich gemacht, des groben Amtsmissbrauch angeklagt und zum Tode verurteilt. Die öffentliche Hinrichtung erfolgte am 5. Mai 1640 . Mit Brüggemann waren auch Friedrichs Handelspläne beerdigt.

Friedrich hatte die schwierige Aufgabe sein weit verstreutes Land durch den Dreißigjährigen Krieg zu führen. Er versuchte es durch eine Politik der Neutralität, was in der Praxis eine Abkehr von Dänemark und eine Hinwendung nach Schweden bedeutete. So verheiratete er seine Tochter Hedwig von Schleswig-Holstein-Gottorf mit dem schwedischen König Karl X. Gustav. Da die schwedische Großmachtpolitik scheiterte, führte diese Politik zur Schwächung des Hauses Holstein-Gottorp.

Erfolgreicher war Friedrich als Förderer von Kunst und Kultur. So wurde er am 3. September 1642 von Ludwig I. von Anhalt-Köthen in die Fruchtbringende Gesellschaft aufgenommen. Außerdem ließ er den Gottorfer Riesenglobus konstruieren.

Verheiratet war er mit Maria Elisabeth von Sachsen , der Tochter von Johann Georg I. von Sachsen. Sie hatten zusammen vier Kinder:

1. Maria Elisabeth von Schleswig-Holstein-Gottorf (* 1634; † 1665), verheiratet mit Ludwig VI. von Hessen-Darmstadt.
2. Hedwig von Schleswig-Holstein-Gottorf (* 1636; † 1715), verheiratet mit Karl X. Gustav von Schweden.
3. Christian Albrecht von Schleswig-Holstein-Gottorf (* 1641; † 1695)
4. Augusta Maria von Schleswig-Holstein-Gottorf (*1647; † 1728), verheiratet mit Friedrich Magnus von Baden .

Nach seinem Tod übernahm sein Sohn Christian Albrecht das Herzogtum.