Die Große Vils hat ihre Quellen bei einem Wäldchen, südlich von Seeon (Gemeindegebiet Lengdorf im Landkreis Erding) auf einer Höhe von 502 m ü. NN. Die Große Vils schlängelt sich immer in nördlicher und östlicher Richtung durch die Orte Taufkirchen (Vils), Velden und Vilsbiburg bis südlich von Gerzen, wo sie sich in auf einer Höhe von 468 m bei 48° 25’ 27’’ Ost und 48° 29’ 53’’ Nord mit der Kleinen Vils zur Vils vereint.