Stein-Säckingen ist eine schweizerische Bahnstation. Die Station liegt auf dem Gemeindegebiet von Stein im Kanton Aargau . Der Doppelname Säckingen wurde wegen des auf der anderen Rheinseite liegenden deutsch -badischen Bad Säckingen (und zur Unterscheidung von anderen Orten namens Stein in der Schweiz) angehängt.

Die Station ist eine Abzweigstation und liegt an der Bözberglinie der Schweizerischen Bundesbahnen zwischen Basel und Zürich.

Stein-Säckingen kann von Basel aus halbstündlich mit der Linie S1 der Regio S-Bahn Basel erreicht werden, dort teilt sich die Linie in einen Ast nach Frick bzw. in den einspurigen Seitenast nach Laufenburg. Daneben halten noch stündlich die Interregio-Züge von Basel nach Zürich-Chur.