Maximilian Werner (* 18. Juni 1815 in Appenweier, † 20. Januar 1875 in Offenburg) war ein badischer Politiker.

Werner studierte von 1836 - 1840 Jura in Heidelberg und Freiburg im Breisgau und war Mitglied des Corps Suevia Freiburg . Anschließend war als Rechtsanwalt u.a. in Oberkirch, Offenburg und Biersfelden ( Schweiz ) tätig.

Von 1848 - 1849 war er Stadtverordneter in Oberkirch sowie als Nachfolger Gustav Rées Abgeordneter in der Frankfurter Nationalversammlung. Er nahm 1848 / 1849 an allen Aufständen der badischen Revolution teil, im Juni 1849 gehörte er der provisorischen Regierung als Kriegsminister an.

1851 wurde er wegen Hochverrats zu einer lebenslänglichen Zuchthausstrafe verurteilt, entzog sich dieser jedoch durch Flucht in die Schweiz .