Die Große Gusen ist ein orographisch linker Nebenfluss der Donau im Mühlviertel (Oberösterreich).

Sie entspringt etwa 10km westlich von Freistadt, nahe Schenkenfelden, und durchfließt in süd- bis südöstlicher Richtung Gallneukirchen und Engerwitzdorf. Hier vereinigt sich die Große Gusen mit der Kleinen Gusen . Wenige Kilometer nach Sankt Georgen an der Gusen mündet der Fluss in die Donau, unterhalb des Donaukraftwerkes Abwinden-Asten .