Die Stadt Basel und ihre nähere Umgebung sind reich an Museen . Diese Liste führt in alphabetischer Reihenfolge alle Museen der Stadt Basel und der Region Nordwestschweiz auf.

• Anatomisches Museum Basel - Originalpräparate von menschlichen Körperbereichen und Organen
• Antikenmuseum Basel - antike Kunst und Kultur des Mittelmeerraumes und dem Vorderen Orient und Zypern
• Architekturmuseum Basel - wechselnde Präsentationen internationaler und Schweizer Architektur
• Ausstellungsraum Klingental - Ausstellungen zum Schaffen der Künstler/innen der Stadt Basel und Region Basel
• Basler Papiermühle - Galliciani-Mühle und Objekte zur Geschichte von Papier, Schrift und Druck
• Cocteau Kabinett - Bücher, Autographen, Zeichnungen, Glas, Keramik von Jean Cocteau
• Fondation Beyeler - Sammlung mit rund 200 Werken der klassischen Moderne wie Monet , Cézanne , van Gogh , Picasso , Warhol , Lichtenstein oder Bacon
• Fondation Herzog - Geschichte der Fotografie und der Industriegesellschaft durch ca. 300'000 Bilder der Sammlung Herzog
• Historisches Museum Basel
  • Barfüsserkirche - Historische Schätze von Basel wie den Münsterschatz, Amerbach-Kabinett, Schätze der Basler Zünfte, Bildteppiche der Spätgotik, Münzkabinett, oberrheinische Bildwerke und Glasmalerei des Spätgotik und Renaissance sowie kirchliche Kunst und Möbel
  • Haus zum Kirschgarten - Basler Wohnkultur des 18. und 19. Jahrhunderts und Spezialsammlungen
  • Kutschenmuseum - Kutschen und Schlitten des 19. und 20. Jahrhunderts aus Basler Familienbesitz
  • Musikmuseum - grösste Schweizer Musikinstrumentensammlung aus 5 Jahrhunderten
• Jüdisches Museum der Schweiz - Geschichte der Juden in Basel, rituelle Gegenstände und Gegenstände vom ersten Zionistenkongress
• Karikatur & Cartoon Museum Basel - Wechselausstellungen von Karikaturen, Cartoons und Comigs
• Kunst Raum Riehen - wechselnde Ausstellungen zeitgenössisches Kunstschaffen aller Sparten
• Kunsthalle Basel - zeitgenössische Kunst, Präsentation aktueller Kunst auch durch Vorträge, Performances oder Video- und Filmvorführungen
• Kunsthaus Baselland - junge zeitgenössische Kunst, speziell auch Experimentelles
• Kunstmuseum Basel - Malerei und Zeichnung oberrheinischer Künstler von 1400 bis 1600 sowie die Kunst des 19. und 20. Jahrhunderts
  • Museum für Gegenwartskunst - wechselnde Präsentationen der Kunst von 60er Jahren bis in die unmittelbare Gegenwart
• Mühlemuseum - Ausstellung über die Geschichte der Mühle Brüglingenund das Hand- und Tagwerk der Müllersleute von der Bronzezeit bis ins 21. Jahrhunderts
• Museum.BL - permanente Ausstellungen Seidenband und Natur nah. Forum zu einer lebendigen und kritischen Auseinandersetzung mit Umwelt, Geschichte und Gegenwart
• Museum am Burghof Lörrach - Dauerausstellung ExpoTriRhena über Geschichte und Gegenwart der Drei-Länder-Region Deutschland, Schweiz, Frankreich. Wechselnde Sonderausstellungen
• Museum der Kulturen Basel - Sammlungen zum Leben in europäischen und aussereuropäischen Kulturen, u.a. Südsee, Altamerika, Tibet und Bali
• Schweizerisches Landesmuseum
  • Museum für Musikautomaten - Sammlung mechanischer Musikautomaten
• Museum Kleines Klingental - Geschichte des Klosters Klingental, mittelalterliche Originalskulpturen des Basler Münsters und ein Modell der Stadt im 17. Jahrhunderts
• Naturhistorisches Museum Basel - Tiere aus der Region und exotische Exemplare. Dinosaurierausstellung sowie Fossilien und bizarre, farbige Mineralien
• Pharmazie-Historisches Museum der Universität Basel - Sammlungen zur Geschichte der Pharmazie
• Plug in - Ausstellungen und Veranstaltungen zur Medienkunst wie Computer-Kunst, Software-Kunst, Internet-Kunst, interaktive Installationen, virtuelle Realität und bewegten Bildern auf Video, DVD, etc.
• Puppenhausmuseum - über 6000 Teddybären, Puppen, Kaufmannsläden, Puppenhäuser und Miniaturen
• Römerstadt Augusta Raurica - Ruinengelände der Römerstadt Augusta Raurica, römischer Haustierpark, Museum im Römerhaus
• Sammlung Friedhof Hörnli - Objekte zur Bestattungskultur wie Aschenurnen, Leichenwagen, Särge, Friedhofsordnungen, Grabkreuze und Totenandenken
• Schweizerisches Feuerwehrmuseum - Geschichte der Feuerbekämpfung, von der mittelalterlichen Handspritze bis zum modernen Sauerstoff-Kreislaufgerät
• Schaulager - Raum für Kunst, für Fachpublikum spezielle Anlässe, auch allgemein zugänglich
• Skulpturhalle - Sammlungen von Abgüssen antiker Plastik, Bauplastik des Athener Parthenons
• Spielzeugmuseum, Dorf- und Rebbaumuseum Riehen - Sammlungen von europäischem Spielzeug aller Art. Dorfmuseum mit Riehener Alltag um 1900. Rebkeller mit Ausstellung über den Weinbau
• Sportmuseum Schweiz - Querschnitt durch Sport und Spiel aus drei Jahrtausenden anhand von Bildern und Objekten.
• Tinguely-Museum Basel - permanente Ausstellung beweglicher Maschienenplastiken und des Lebens des Eisenplastikers Tinguely. Wechselnde Sonderausstellungen
• Verkehrsdrehscheibe Schweiz und unser Weg zum Meer - Schifffahrtsmuseum mit grossem Modell der Rheinhäfen von Basel, aktuelle Verkehrsträgerschau im Wasser, auf Schiene, Strasse und in der Luft
• Vitra Design Museum - industrielles Mödeldesign und Architektur, wechselnde Ausstellungen

Daneben haben viele Dörfer ihr eigenes Dorfmuseum oder ein Regionalmuseum mit lokalhistorischem Ausstellungsgut.