Die Heiliggeistkirche ( dänisch : Heligåndskirke) ist Hauptkirche der Dänischen Kirche in Flensburg.

Die gotische zweischiffige Hallenkirche ist nach dem Heiligen Geist benannt. Die Kirche wurde 1386 als Kirche des Hospital zum Heiligen Geist gebaut. Bereits seit 1588 werden in der Kirche Gottesdienste in dänischer Sprache gehalten. Bemerkenswert sind die mittelalterlichen Fresken , der Barock-Altar und mehrere Votivschiffe im Inneren der Kirche. Die eindrucksvolle Renaissance-Kanzel ist leider zu Beginn des 20. Jahrhunderts entfernt worden. Die Heiliggeistkirche war vor allem Kirche der Schiffer .

Die Kirche befindet sich direkt in der Flensburger Altstadt .