Der Bahnhof Zwiesel ist der bedeutendste Eisenbahnknoten im Bayerischen Wald. In der Glasmacherstadt Zwiesel gelegen, treffen sich hier neben der 1877 eingeweihten Hauptstrecke Plattling - Bayerisch Eisenstein (Bayerische Waldbahn) auch die beiden Nebenstrecken nach Bodenmais (seit 1928 ) und Grafenau (seit 1890 ) ( Kursbuchstrecke 906 ). Dieses Streckennetz wird deshalb auch Zwieseler Spinne genannt. Der Bahnhof ist der einzige noch besetzte Bahnhof in diesem Schienensystem und wird von der Regentalbahn betrieben.

Bis zum Jahr 2000 war Zwiesel noch ein Fernverkehrsbahnhof , über den Kurswagen Touristen in den Bayerischen Wald brachten. So verkehrten hier bis 1987 einstige Trans-Europ-Express -Garnituren als Alpen-See-Express und danach Intercity - Kurswagen , etwa als IC-Arber oder IC-Bayerwald. Heutzutage wird der Zugbetrieb, von seltenen Sonderfahrten abgesehen, nur noch mit den grün-gelben Regio-Shuttles der Regentalbahn durchgeführt.