Die Pfettrach ist ein linker Nebenfluss der Isar.

Sie entspringt nördlich von Obersüßbach in dem Waldgebiet Gschwandholz auf einer Höhe von 480 m ü. NN . Nach 24 Kilometern mündet sie westlich von Landshut auf einer Höhe von 385 m ü. NN in die Kleine Isar.

Die Pfettrach ist das wichtigste Gewässer im nordöstlichen Landkreis Landshut. Ihr Einzugsgebiet umfasst etwa 167 km². Wichtigster Zufluss ist der Further Bach.